MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 6849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008340	CA	3	6	441239	441244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_008340	GCTAG	2	10	441257	441266	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1005	NC_008340	CGGC	2	8	445307	445314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_008340	GGCC	2	8	445320	445327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_008340	GCC	2	6	445949	445954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_008340	GGC	2	6	445956	445961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008340	CGC	2	6	445974	445979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_008340	GC	3	6	446010	446015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_008340	CGC	3	9	446013	446021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_008340	CCG	2	6	448656	448661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_008340	GCCAC	2	10	448672	448681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1014	NC_008340	CCCATG	2	12	448688	448699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_008340	G	6	6	448699	448704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008340	GGTA	2	8	450300	450307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008340	CTT	2	6	453183	453188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008340	CCA	2	6	453234	453239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_008340	GCC	2	6	453240	453245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_008340	CG	3	6	455929	455934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_008340	C	6	6	460758	460763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1022	NC_008340	CCCACG	2	12	462227	462238	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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1024	NC_008340	GGT	2	6	462288	462293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008340	GAT	2	6	462296	462301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1030	NC_008340	GCCCG	2	10	462437	462446	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1031	NC_008340	ATC	2	6	462447	462452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1034	NC_008340	GTC	2	6	464245	464250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_008340	CG	3	6	465889	465894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_008340	GGT	2	6	466667	466672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008340	GCCT	2	8	467879	467886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1061	NC_008340	GAG	2	6	470303	470308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_008340	GGGC	2	8	488093	488100	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1106	NC_008340	GTG	2	6	488235	488240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008340	AG	3	6	488273	488278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008340	GGC	2	6	488373	488378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008340	GCG	2	6	488431	488436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1113	NC_008340	GCA	2	6	488681	488686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_008340	CCAG	2	8	489337	489344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1125	NC_008340	GTC	2	6	489392	489397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_008340	TCGTG	2	10	489401	489410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_008340	TCGG	2	8	489467	489474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_008340	GGA	2	6	489505	489510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008340	TCA	2	6	489530	489535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1131	NC_008340	TGC	2	6	489696	489701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_008340	AC	3	6	489726	489731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_008340	CCT	2	6	489867	489872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_008340	AG	3	6	489877	489882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_008340	ATT	2	6	490029	490034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008340	GTC	2	6	490246	490251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_008340	TCG	2	6	490418	490423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_008340	AGG	2	6	491543	491548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_008340	TCC	2	6	492948	492953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1192	NC_008340	GGT	2	6	499548	499553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_008340	AGG	2	6	537330	537335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_008340	CCG	3	9	538632	538640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1257	NC_008340	CGA	2	6	538726	538731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_008340	GTAG	2	8	539517	539524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_008340	CTCC	2	8	539561	539568	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1260	NC_008340	ATTCA	2	10	539578	539587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1264	NC_008340	GCC	2	6	539776	539781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_008340	CAG	2	6	540869	540874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_008340	ACGC	2	8	540955	540962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1268	NC_008340	AT	3	6	540987	540992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_008340	ACA	2	6	540997	541002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_008340	TGC	2	6	541109	541114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_008340	GTC	2	6	541130	541135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_008340	CGG	2	6	607200	607205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_008340	GGC	2	6	642156	642161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_008340	GCCG	2	8	645315	645322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1472	NC_008340	ACG	2	6	645341	645346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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